Bioreaktor je uređaj ili sistem koji koristi biološke procese za proizvodnju hemikalija, lekova, hrane ili energije. Ovi reaktori optimizuju uslove za rast i metabolizam određenih mikroorganizama ili ćelijskih kultura. Bioreaktori su ključni u biotehnologiji i farmaceutskoj industriji.
Bioreaktori se koriste i za proizvodnju biogoriva i održivih izvora energije. Oni su ključni u razvoju metoda za efikasno recikliranje otpada. U bioreaktorima se takođe proučavaju složeni ekosistemi, kao što su mikrobiomi.