Zooarheologija je grana arheologije koja proučava životinjske ostatke pronađene na arheološkim lokalitetima kako bi se steklo znanje o odnosima između ljudi i životinja u prošlosti. Ova disciplina analizira kosti, zube, školjke, rogovlje i druge delove životinja kako bi otkrila informacije o ishrani, lovu, pripitomljavanju i trgovini životinjama.
Zooarheolozi proučavaju kako su različite kulture koristile životinje za hranu, alatke, odeću, transport i ritualne svrhe. Na primer, analiza životinjskih kostiju može otkriti metode lova i uzgoja stoke, sezonske migracije životinja i načine na koje su drevni ljudi koristili životinjske resurse. Takođe se proučava način pripitomljavanja i selektivnog uzgoja životinja, što je imalo značajan uticaj na razvoj poljoprivrede i ljudske civilizacije.
Ova disciplina pomaže arheolozima da bolje razumeju ekonomske sisteme, prehrambene navike i društvene strukture drevnih zajednica. Zooarheologija je takođe ključna za proučavanje ekologije prošlih vremena, jer pruža podatke o biodiverzitetu i promenama u okolišu koje su uticale na ljudski život i korišćenje prirodnih resursa.